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利用平板培养法,从棉花根际中分离出400多个细菌分离物,根据在CAS检测平板上形成显色圈的大小,从中筛选出铁载体合成能力较强的分离物E19。同样的方法,从花生根际中筛选出铁载体产生菌D15。通过.形态观察、生理生化鉴定,E19和D15都是革兰氏阴性无芽孢杆菌,属于假单胞菌属,16S rDNA测序结果表明,两者的16S rDNA序列与Pseudomonas putida 16S rDNA序列同源性为100%。
用抗生素梯度平板法,对Pseudomonas putida E19和D15进行药敏试验,E19和D15都对卡那霉素敏感,能够耐受50μg/mL以上的氯霉素。用转座子Tn5-1063分别对E19和D15进行转座子插入诱变,从E19的转座突变株中,筛选到22株铁载体合成缺失突变株,分别为:E1-19、E3-54、E4-69、E7-13、E7-66、E7-82、E7-85、E10-27、E10-76、E11-67、E12-38、E12-48、E13-3、E13-32、E13-56、E14-6、E14-38、E3-54、E4-50、E8-32、E8-87、E12-64。从D15的转座突变株中,筛选到1株铁载体合成缺失突变株D15-4。根据转座子Tn5-1063上的luxA序列设计引物,分别以E19和D15总DNA、pRL1063a质粒DNA和突变株总DNA进行PCR扩增,测序结果表明,铁载体合成缺失突变株中luxA序列与Tn5-1063的luxA序列同源性均为100%,由此证实,转座子插入到E19和D15的基因组中。
根据转座子Th5-1063两端的序列,分别设计3个嵌套引物,同时设计了7个随机引物,用TAIL-PCR(Thermal asymmetric inter laced PCR)方法,从突变株D15-4中克隆获得了转座子侧翼序列。采用TAIL-PCR与特异性PCR扩增相结合,克隆了P.putida D15铁载体合成相关基因簇cysPTWA。cysPTWA基因簇与细胞中硫酸盐吸收和代谢有关,而硫酸盐为半胱氨酸合成提供巯基。转座子插入到cysP和cysT基因间区域,由于极性效应,降低了其下游基因cysTWA的表达效率,影响了硫酸盐的吸收,半胱氨酸合成受阻,从而影响突变株铁载体的合成效率。用硫酸盐吸收实验对其功能进行了验证。
从突变株E13-32中克隆到铁载体合成相关的psvA基因片断,在Pseudomonas entomophila str.L48中,psvA编码铁载体pyoverdinesynthetase A,该基因与pyoverdine铁载体的合成直接相关。