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该发明公开了一种高COD、高浓度硫酸根酸性有机化工废水处理方法,主要包括Ca(OH),预处理、厌氧处理、两段好氧处理等步骤。在对酸性有机化工废水进行Ca(OH),预处理去除大部分硫酸根和H^+后,通过对废水处理微生物主体和操作参数因子进行控制,形成以厌氧细菌为优势的厌氧废水处理菌群和以嗜盐及耐盐好氧微生物处理为主的好氧曝气处理菌群,