同义密码子相关论文
通过病毒分离培养技术,从牦牛血清中分离获得一株致细胞病变的牛病毒性腹泻病毒(BVDV),命名为GSTZ毒株。经电镜观察,GSTZ毒株的直径在5......
脯氨酸残基对于蛋白质结构与功能具有重要意义。脯氨酸具有特殊的环状结构,加强了对肽链结构的限制,可赋予生物大分子很多特殊的生......
作为大自然最伟大的创造之一的遗传密码究竞是如何起源与进化的一直是生命起源研究领域的热点问题。迄今,己有不少作者分别从不同......
目的: [1]预测并筛选富含B细胞表位和CTL表位的HCMV UL138片段。 [2]构建富含B细胞表位及CTL表位片段的毕赤酵母真核表达质......
流感病毒属于正黏病毒科(Orthomyxoviridae),是主要威胁人类健康的病毒之一。在上世纪已经多次造成了大范围瘟疫,导致人类大量死亡......
本论文共分三部分: 第一部分通过对大肠杆菌编码序列中同义密码子重复序列的研究,分析了同义密码子重复序列与全部编码序列中密......
分析了78个人类基因(19 967个密码子)中同义密码子的偏好使用情况, 计算了同义密码子的相对使用度和各种二核苷酸在密码子2,3位和3......
基因组中的基因和基因密码子组成不同使柞蚕核型多角体病毒(ApNPV)与家蚕核型多角体病毒(BmNPV)间不能交叉感染.通过计算有效密码......
对62个人基因中编码蛋白质各类二级结构(α-螺旋、β-折叠片、无规卷曲和回折)的密码子前后碱基的使用情况进行统计分析和比较,发......
p53是人类恶性肿瘤中最常见的突变基因,与人类肿瘤的发生相关性最高,也是基因研究中热度最高的基因之一。为深入研究人类p53基因突......
为了深入研究人类p53肿瘤蛋白,对七条最新的人类p53肿瘤蛋白的mRNA序列的偏好性及其同源性进行了分析。利用MEGA4.0(molecular evo......
对人(Homo sapiens)的117个蛋白质和大肠杆菌(Ecoli)的87个蛋白质的各二级结构相对应的mRNA序列中的密码子上下文关联作了统计分析......
以猪链球菌GZ1为研究对象,利用Codon W在线工具、对应分析、ENC绘图(Nc-plot)等方法研究其基因组的密码子使用情况及影响因素。猪链......
以RT-PCR方法对河南省洛阳地区2000~2002年分别从IBD发病蛋鸡和乌鸡鸡群中分离到的5株和4株IBDV进行了VP2高变区基因的扩增、克隆和......
目的:如同密码子的偏爱性使用一样,密码对的使用也有偏爱性,为了揭示基因组中密码对使用的规律,对闪烁古生球菌基因组中密码子及其......
通过对人(Homo sapiens)的117个蛋白质和大肠杆菌(E.coli)的87个蛋白质的统计分析,发现mRNA序列中的同义密码子与氨基酸的上下文关......
从概率论的角度出发,以人和大肠杆菌蛋白质为模式,研究了蛋白质二级结构中有显著统计意义的mRNA序列上的密码子上下文关联,以及蛋......
以闪烁古生球菌、枯草杆菌、大肠杆菌、酵母、线虫和拟南芥基因组中所有ORF序列为样本,对编码序列中同义密码子重复序列和对应氨基......
目的:利用ARIMA模型对木聚糖酶(Xylanase)F/10和G/11家族的进化过程进行分析,并分析两家族中同时含量较高的氨基酸在进化中的特征。方......
统计分析了119种人蛋白质和92种大肠杆菌蛋白质的mRNA序列和蛋白质二级结构的关系.从二肽频数出发,研究了同义密码子使用对蛋白质......
恶性疟原虫的全基因组序列以及泛基因组的表达数据已经在PlasmoDB公开,在此基础上乌拉圭的科学家对恶性疟原虫的密码子使用模式以及......
使用Codon W软件分析大头金蝇[Chrysomya megacephala(Fabricius,1794)]转录组10923条全长转录序列的密码子偏好性。结果表明,大头......
用信息类聚方法研究了猪瘟病毒基因表达水平与同义密码子使用频率的关系, 求出了猪瘟病毒基因组各同义密码子的相对使用频率,得到......
利用系统聚类分析方法对随机选取的3种哺乳动物的60个主要组织相容性复合体(MHCⅠ类和Ⅱ类)基因的mRNA序列进行了同义密码子使用概......
转录组的多态性是探讨物种多样性与分子进化的重要方面。笔者选取物种间保守性较高的HSP70、HSP90蛋白作为研究对象,探讨二者在松......
猪瘟病毒(CSFV)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)和羊边界病毒(BDV)是黄病毒科瘟病毒属成员,分析这3种病毒多聚蛋白酶基因密码子使用特点,......
对人体117个蛋白质和大肠杆菌的185个蛋白质的各二级结构相对应的mRNA序列中的同义密码子与氨基酸上下文关联熵、蛋白质序列中氨基......
根据已释放的基因组序列,对野油菜黄单胞菌野油菜致病变种(Xanthomonas campestris pv.campestris,Xcc)和地毯草黄单胞菌柑桔致病......
考虑到同义密码子使用偏性的物种差异性,选取大肠杆菌的54条核蛋白为研究对象,将每条核蛋白按二级结构截取出α螺旋片段、β折叠片段......
对人(Homo sapiens)的117个蛋白质和大肠杆菌(E.coli)的87个蛋白质的各二级结构相对应的mRNA序列中的密码子前后双碱基关联作了统......
目前,有关同义密码子使用偏性对蛋白质折叠的影响研究中,样本蛋白均来源于不同的物种。考虑到同义密码子使用偏性的物种差异性,选......
利用635个包含完整转座因子插入的粳稻CDS序列,对转座因子如何影响基因编码区的碱基组成及基因的表达水平,进而对基因同义密码子的......
针对蛋白质序列中氨基酸的核苷酸组成部分及其相关特征信息,提出另外的σ-等序列的概念,并讨论了其主要特征与次要特征,可作为对蛋......
密码子偏性指同义密码子的非均衡使用。研究密码子偏性模式、密码子偏性的形成因素具有重要的生物学意义。本文主要阐述了密码子偏......
研究了腈类降解微生物基因最优密码子及其同义密码子相对使用频率,探讨了不同腈类降解微生物最优密码子特定的相似与不同,并借助了统......
为了研究禽腺病毒1型和4型(AAV-1和AAV-4)六邻体抗原表位和同义密码子的使用情况,运用生物学软件Antheprot5.0和EMBOSS的CHIPS、CU......
生物信息学是随着人类基因组计划(Human genome project,HGP)的启动而发展起来的一门新兴学科。1995年,在HGP第一个五年总结报告中......
为了探讨基因组序列的非随机性对密码对使用的影响程度,揭示依赖上下文的密码对偏爱性(CDCB)可能存在的规律,本文主要对大肠杆菌基......
犬细小病毒是一种对犬科动物危害严重的DNA病毒,为了解其主要蛋白的密码子使用特点,本文运用EMBOSS(The European Molecular Biology ......
从信息学的角度,对人(Homo sapiens)的117个蛋白质和大肠杆菌(Ecoli)的185个蛋白质的各二级结构相对应的mRNA序列中的密码子上下文......
应用信息论方法考察了大肠杆菌和人两种生物的同义密码子用语和蛋白质二级结构的关联情况.研究结果表明:大肠杆菌和人的基因组中都......
本文利用已知序列的四种物种:人、鸭、鸡、猪的A型流感病毒基因序列.利用生物统计的方法:相关分析(Correlation Analysis)和对应分析(Co......
密码子水平的生物信息学分析是研究基因组进化、蛋白质功能以及遗传和环境相互作用等课题中一个的重要环节。本文中,我们从密码子使......
蛋白质是生命活动的主要承担者,是一类最重要的生物大分子,在生物体内占有特殊的地位。自然状态下,蛋白质通常可以从未折叠的状态......
计算了基于拟氨基酸编码方法下的同义密码子的相对使用度,分析了78个人类基因(19967个密码子)中基于拟氨基酸编码方法下的同义密码......
【目的】分析黄病毒科瘟病毒属的猪瘟病毒(CSFV)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)和羊边界病毒(BDV)3种病毒多聚蛋白酶基因密码子的使用特......